Şeref Naci Engin 1985 yılında Yıldız Teknik Üniversitesi’nden (YTÜ) Elektrik Mühendisi olarak mezun oldu. 1988 yılında aynı okulda mastır yaparak Elektrik Yüksek Mühendisi unvanını aldı. 1989-1990 yıllarında bir yıl süreyle Milli Savunma Bakanlığı (MSB) adına MKEK’da Kalite Kontrol Mühendisi olarak görev yaptı. 1991-1992 yıllarında Savunma Sanayii Müsteşarlığı (SSM) araştırmacısı olarak İspanya’da bir yıl süreyle Otomatik Uçuş Kontrol Sistemleri alanında uygulamalı eğitim aldı. YÖK bursuyla 1994 - 1998 yılları arasında University of Hertfordshire, İngiltere'de İleri Sinyal İşleme Teknikleriyle Makine Durum İzleme konusunda doktora yaptı. İngiltere’de 2000 yılına kadar araştırmalarına devam ettikten sonra 2000 yılı Ocak ayında yurda dönerek YTÜ’de Öğretim Üyesi (Yardımcı Doçent) olarak çalışmaya başladı. Otomatik Kontrol ve Endüstriyel Otomasyon alanında dersler verdi, tez danışmanlıkları yaptı, araştırma projeleri yönetti, ulusal ve uluslararası makale ve bildiriler yazdı ve sundu. 2009 Temmuz’da Üniversitedeki fiili görevinden ayrılarak TÜBİTAK Marmara Araştırma Merkezi, Enerji Enstitüsü’nde Baş Uzman Araştırmacı olarak Güç Elektroniği ve Kontrol Teknolojileri Ar-Ge grubuyla özellikle Rüzgâr Enerjisi, Enerji Otomasyonu ve Akıllı Şebekeler konularında çalışmaya başladı. Enerji Enstitüsü’ndeki görevinin yanı sıra aralıklarla YTÜ ve GYTE’de Lisans Üstü dersler vermeye devam etti, tezler yönetti. 2012 yılında YTÜ Teknopark Genel Müdürlüğü, 2013 yılında YTÜ Teknoloji Transfer Ofisi Yöneticiliği görevlerine getirildi. Ocak 2014’te Doçent unvanını aldı ve Şubat 2014’te akademik kadroya geri döndü. Üniversitedeki Ar-Ge çalışmalarının yanı sıra merkezi YTÜ Teknopark’ta yer alan, kurucu ortağı olduğu RoboGör Robot ve Görme Teknolojileri Ar-Ge San. Tic. Ltd. Şti. ile endüstriyel Ar-Ge danışmanlıkları yapmakta, projeler yürütmektedir. 15 Ağustos 1964 doğumlu, evli ve bir çocuk babasıdır.